GARA: predicción y visualización de estructuras proteicas 3D sobre el supercomputador de CESGA
Hugo Gómez-Randulfe, estudiante del grado Ingeniería Informática (USC)
Pablo Pardo Cotos, estudiante del doble grado de Ingeniería Informática y Matemáticas (UCM)
Javier Outeriño Cortes, graduado en Ingeniería Informática (USC)
Theatre room, CiMUS
About
GARA es una plataforma web que permite predecir la estructura tridimensional de una proteína a partir de su secuencia, ejecutando modelos de vanguardia en el supercomputador Finis Terrae III de CESGA. Los resultados se ven directamente en el navegador: modelos 3D interactivos, confianza por residuo (pLDDT/PAE), comparación y superposición de estructuras, alineamiento de secuencias, análisis bioquímico, mutación de residuos in silico con detección de choques estéricos.
En la demostración recorreremos el flujo completo, de la secuencia FASTA al modelo 3D analizable, con ejemplos orientados la investigación biomédica.
https://gara.bio/ (Predicción y análisis de complejos moleculares. Supercomputación para biomedicina, desde el navegador.)
Un proyecto del ecosistema: Cátedra Camelia, CESGA, Citius y USC.
Se entregarán certificados de asistencia a quienes los soliciten enviando un correo electrónico a cimus.xestion [at] usc.es (cimus[dot]xestion[at]usc[dot]es). No olvides inscribirte (nombre y apellidos completos) en la hoja impresa.